第1集：乱世中，日本被突然飞来的神秘生命体“鬼神”所支配，反抗鬼神的武士被视为大罪人，被忌讳。在人们崇拜鬼神的过程中，武藏有一个秘密的梦想。那就是和青梅竹马的小次郎一起组成“最强的武士团”，消灭鬼...

第2集：武藏和小次郎面对突然出现的鬼神“炎狱天狗”，小次郎被炎狱天狗夺走了刀。刀是亡父自斋的遗物，也是武士的证明。光是武士从小就受到歧视、虐待，对武士的血流抱有复杂想法的小次郎，被问及作为武士的觉悟。武藏为了夺回刀，勇敢地一个人向炎狱天狗进发...

第3集：出现在武藏和小次郎面前的是武田武士团，武藏想在武田之前打倒鬼神·炎狱天狗取得功绩。但是，团长武田尚虎却对他说：“你不是鬼神·炎狱天狗的对手。”另一方面，小次郎感慨颇深地注视着武田武士团与鬼神战斗的样子...

第4集：武藏和小次郎离开安艺龙山町，踏上了外面的世界。不久后两人面前出现了一位少女，小雨田武士团的服部鸫。被鸫夺走了鬼铁骑的武藏和小次郎为了夺回而前往稻谷所在的五月雨城...

第5集：为了取回被鸫夺走的鬼铁骑，武藏和小次郎来到五月雨城。大量的木灵鬼逼近那里，虽然木灵鬼个体是弱小的，但成群结队地涌来，就会发挥出像巨大的破坏力，是一个很麻烦的鬼...

第6集：木灵鬼离开了，小雨田城像受到大灾害一样遍地瓦砾。武藏和小次郎决定帮助城堡复兴。另一方面，虽然鸫在与英雄的直接对决中获胜，但仍无法从英雄的精神统治中逃脱...

第7集：来到大东矿山的武藏和小次郎立刻去买唯一能打倒鬼神的鬼铁刀。两个人接受了“刀的试验”。鬼铁刀只有通过试刀而被选中的人才能拿到，但是武藏和小次郎握着刀的那个瞬间，发生了异变……

第8集：武藏和小次郎接受了刀的试验，在刀的试验中成功小次郎得到了鬼铁刀・裂空八重樱，和武士们一起前往大东矿山打退鬼神。另一方面武藏因试刀失败而绝望...

第9集：武藏受到了打击，身体加速地染上了黑色的矿石。另一方面，为了惩办鬼神·阿形吽形的小次郎和鸫遭遇了“拔刀”。拔刀是指为了夺取鬼铁刀的力量而杀死主人....

第10集：在连警员都被召集起来的早会上，山田说的一句话让大家惊呆了，“警察手册丢了”。町山警署为了不让警察失去信用而行动起来...

第11集：沉睡在武藏之中的“黑曜女神”觉醒了，女神将所有的刀气都吸引过来，可以操纵“鬼铁刀的统治者”。但是能在现世的时间是有限的。黑曜女神聚集了武士们的刀气，使出最后的力量……